L’institut Bergonié est un centre labellisé de lutte contre le cancer qui allie soin et activité de recherche. Il est doté d’une direction Données et santé numérique (DDSN) en charge de l’innovation organisationnelle et technologique, du développement du soin à l’aide de dispositifs de santé numérique, du traitement et études de données de vie réelle, du traitement bio-informatique de la médecine de précision. Cette direction regroupe une quinzaine de personnes, principalement des ingénieurs possédant une double compétence en santé et en informatique constituant l’unité bioinformatique, à laquelle vous serez rattaché(e).
Mission principale :
Vous assurerez l’interopérabilité des données de plusieurs projets en vous appuyant sur le standard OSIRIS (INCa) développé pour structurer et standardiser les données en cancérologie. Vous conduirez le nettoyage, la transformation et la standardisation des données (ETL, connecteurs) et vous développerez des outils autour d’OSIRIS et d’aspect d’analyse de données.
Activités générales :
- Assurer les activités de structuration, standardisation, ETL et connecteurs en phase avec le standard OSIRIS.
- Travailler sur une extension du modèle OSIRIS pour l’oncogériatrie.
- Créer des outils autour du standard OSIRIS.
- Rédiger la documentation liée aux activités et former les utilisateurs.
Activités spécifiques :
- Assurer la cohérence des traitements de données avec la réglementation.
- Corriger et compléter les données
- Interagir avec les biologistes et cliniciens en adéquation avec les besoins des projets.
- Travailler en équipe avec autres bio-informaticien de l’unité pour la bonne articulation des différents projets
Profil attendu :
- Ingénieur informatique (biologie/santé), Master bio-informatique ou informatique médicale, équivalent …
- Forte appétence pour la standardisation des données
- Intérêt pour l’analyse de données
- Connaissance en cancérologie
Compétences requises :
- Travail sous environnement linux
- Maitrise du langage Python
- Gestion de version Git
- Organisation, stockage de données
- Standard, UMLS, SIRIC OSIRIS, interopérabilité
- Autonomie et capacité d’apprentissage rapide
Atouts du poste :
- Accessibilité: transports en commun à proximité, places de parking, parking vélos sécurisé.
- Prise en charge de l’abonnement transport en commun à 60%
- Comité Social et Économique : chèques cadeaux, chèques rentrée scolaire, places de cinéma…
- Restauration collective sur place avec tarif préférentiel (3,26€)
Plage horaire :
- Lundi au vendredi
- 39h/ semaine
- 22 RTT + 25 congés payés
- Télétravail possible sous réserve de l’accord du supérieur hiérarchique
Rémunération
Catégorie selon grille de rémunération des CLCC, 37,4 K€ bruts/an.
CANDIDATER
Les personnes intéressées voudront bien adresser leurs candidatures (lettre de motivation + CV actualisé) à la Direction des Ressources Humaines par mail à bergonie.recrutement@bordeaux.unicancer.fr
