Laboratoires - Bergonié

Cadre du département : Mme Karine Peutat – 05 56 33 33 36

Ingénieur qualité du département : Mme Anulka Kestemont – 05 56 33 33 32

L’intérêt de ce département est de pouvoir participer à une prise en charge globale des patients en cancérologie, en intégrant de façon multidisciplinaire les techniques de laboratoire les plus fiables mais aussi les plus innovantes.

Le département de BioPathologie de l’Institut Bergonié a trois missions fondamentales :

Soin: assurer le diagnostic et orienter la prise en charge thérapeutique des patients atteints de pathologie cancéreuse ou précancéreuse ainsi que le dépistage d’anomalies génétiques prédisposant à la survenue de cancers.
Recherche: chercher les anomalies génétiques et moléculaires intervenant dans l’apparition et la progression des cancers et mettre au point des techniques de détection de ces anomalies applicables à la routine diagnostique. Le département de BioPathologie travaille étroitement avec l’unité INSERM U1218 ACTION.
Enseignement et communication: Transmettre les connaissances liées au cancer et à la prise en charge des patients souffrant d’une pathologie cancéreuse auprès des professionnels et du public.

Le département de BioPathologie est accrédité par le Comité Français d’Accréditation (COFRAC), assurant que le DBP répond aux exigences de qualité et compétence de la norme NF EN ISO 15189 (N° d’accréditation 8-3439). La liste des portées accréditées est disponible sur le site du COFRAC.
La liste détaillée des examens est disponible dans le SH FORM 06.

Le Département de Biopathologie a mis en place en avril 2016 un nouveau logiciel, dénommé ARIANE Sx permettant de gérer les activités de laboratoire des unités d’anatomocytopathologie, du Centre de Ressources Biologiques, d’oncogénétique et de pathologie moléculaire. Cet outil informatique est adapté à la multiplication et à l’automatisation des analyses, à la nécessité de mettre en commun des résultats d’analyses tissulaires et moléculaires, en y intégrant des données cliniques, et à l’obligation de sécuriser et de tracer les prélèvements dans la chaîne de production des examens. Ce logiciel est le fruit d’une collaboration avec le Centre Léon Bérard, l’Institut Curie et un industriel, Infologic-Santé. Il est né d’une vision commune du laboratoire du futur pour le diagnostic en cancérologie.

SIGNATURE D’UNE CONVENTION DE PARTENARIAT AVEC TERASCOP

La société Terascop et l’Institut Bergonié ont officialisé la signature d’une convention de partenariat en septembre 2018 à Bordeaux. L’Institut Bergonié s’inscrit ainsi en pionnier du réseau d’excellence créé par Terascop.
Pour consulter le communiqué de presse, cliquer-ici.

Pour accéder à l’article presse réalisé par Sud Ouest, cliquer-ici.

Actualités

Mise en place de l'appareil Rarecells®

Le laboratoire de biologie médicale a inauguré, en juin 2017, l’appareil RARECELLS®, acquis grâce au don du Comité Féminin Gironde. L’arrivée de la méthode d’isolement par la taille des cellules tumorales (ISET) ouvre de nouvelles perspectives dans la prise en charge précoce et affinée du cancer.

Cette méthode permet de détecter, par une simple prise de sang, le début de l’invasion du cancer et donne la possibilité de faire un diagnostic avant que la tumeur ou ses métastases ne soient détectables par imagerie. Elle pourra aider à traiter précocement et à prévenir les métastases. La possibilité de réaliser des analyses génétiques sur les cellules isolées permettra également de caractériser précisément les anomalies et pourra aider au développement de traitement ciblés.

Sa 1ère utilisation est dédiée à des projets de recherche dans le cadre des sarcomes métastatiques.

Accréditation du Département de Biopathologie selon la norme NF EN ISO 15189

Du 21 au 23 août 2018, s’est déroulée l’évaluation de renouvellement de l’accréditation selon la norme NF EN ISO 15189 du Département de Biopathologie à l’issue de laquelle l’accréditation va être reconduite pour une durée de 5 ans.

Les 4 unités du Département de Biopathologie : Biologie Médicale (Dr Durrieu), Anatomie Et Cytologie Pathologiques (Dr MacGrogan), Génétique Somatique (Dr Soubeyran) et Genetique Constitutionnelle (Dr Longy – Pr Sévenet) ont présenté des examens en ajout ou en extension ce qui couvre plus de 72% des examens réalisés.

Le bilan de cette visite est très positif. Neuf écarts non critiques ont été relevés dont les plans d’actions immédiatement proposés ont été jugés satisfaisants par les évaluateurs. Des points d’amélioration et surtout beaucoup de points forts ont été mis en évidence. Ce succès résulte de l’implication de tous les acteurs du Département de Biopathologie et notamment des Gestionnaires Qualité (Charlotte Primois, Delfine Lafon, Sandrine Picard et Florian Renaud) de chacune des unités très engagés au quotidien. Les évaluateurs COFRAC ont conclu sur la très grande compétence du personnel et sur une démarche qualité très dynamique et performante.

Plus de 80 professionnels de la santé travaillent dans le département :
12 médecins, 1 pharmacien, 4 assistants spécialistes des CLCC, 5 ingénieurs biologistes, 1 responsable qualité, 1 cadre médico-technique de laboratoire, 1 conseillère en génétique, 42 techniciens, 2 assistants techniques et 10 assistantes médicales
qui travaillent sur une surface d’environ 1200 m² répartis en 5 unités.

Le département de BioPathologie de l’Institut Bergonié est constitué

de 5 unités spécialisées différentes :

Unité d'Anatomie et Cytologie Pathologiques

L’Unité d’Anatomie et Cytologie Pathologiques où s’effectue l’analyse des tissus et des cellules pour établir le diagnostic et le pronostic des cancers mais aussi pour chercher des facteurs prédictifs de réponse aux différents traitements. Les médecins de cette unité ont une expertise reconnue dans les domaines de la pathologie des tissus mous, du sein, de la gynécologie et de l’hématologie solide.

L’équipe

Dr Houda BEN REJEB, Dr Benjamin BONHOMME, Dr Florence CHASSAIGNE, Pr Jean-Michel COINDRE, Dr Sabrina CROCE, Dr François LE LOARER, Dr Gaëtan MAC GROGAN (Coordonnateur du département, responsable d’unité), Dr Raul PERRET, Dr Isabelle SOUBEYRAN

Plateau Technique

L’unité d’anatomie et de cytologie pathologiques dispose de tous les automates nécessaires à la réalisation des techniques histologiques et cytologiques et de 4 automates Benchmark Ultra de Roche Diagnostics pour la réalisation des techniques immunohistochimiques.

⌈Pour nous envoyer un prélèvement en vue d’un examen d’Anatomie et Cythologie Pathologiques :

〉Prélevements intramuros

Manuel prélèvement : ACP-DCO-0007
Catalogue de prestations et d’analyses unité d’Anatomo-Cyto-Pathologie : ACP-DCO-0003
Fiche de demande d’examen anatomo-pathologique : ACP-FQ-0046
Conditions d’envoi des pièces opératoires au laboratoire d’Anatomo-Cyto-Pathologie : ACP-PROC-0016
Conditions et envoi des biopsies au laboratoire d’Anatomo-Cyto-Pathologie : ACP-PROC-0009
Modalités de transport des prélèvements vers le laboratoire d’Anatomo-Cyto-Pathologie : ACP-FICO-0010
Gestion des prélèvements urgents : ACP-FICO-0011
Critères d’acceptation préanalytique : ACP-PROC-0006
Frottis et prélèvements de liquides biologiques autres que le sang : BIOL-PROC-0041
Destination des frottis et des liquides biologiques autres que le sang : BIOL-LOG-0013
Biopsie Ostéo-médullaire (B.O.M.) : SOINS-FITC-0008
Communication entre le Bloc Opératoire et le laboratoire d’Anatomo-Cyto-pathologie : ACP-FICO-0015

〉Prélèvements réalisés à extérieur de l’Institut Bergonié

Manuel prélèvement : ACP-DCO-0007
Catalogue de prestations et d’analyses unité d’Anatomo-Cyto-Pathologie : ACP-DCO-0003
Fiche de demande d’examen anatomo-pathologique : ACP-FQ-0046
Critères d’acceptation préanalytique : ACP-PROC-0006
Modalités de transport des prélèvements externes vers l’Unité d’Anatomie et cythologie pathologiques : ACP-FICO-0019

⌈Pour nous adresser une demande d’avis anatomopathologique et/ou de relecture :

Manuel prélèvement : ACP-DCO-0007
Demande d’avis anatomo-pathologique et/ou relecture : ACP-FQ-0029
Catalogue de prestations et d’analyses unité d’Anatomo-Cyto-Pathologie : ACP-DCO-0003
Modalités de transport des prélèvements externes vers l’Unité d’Anatomie et cythologie pathologiques : ACP-FICO-0019

Unité de Biologie Médicale

Le laboratoire de biologie médicale participe à prise en charge du patient par la réalisation du dosage d’analyses sanguins, médullaires, urinaires ou d’autres prélèvements liquides :

Ces dosages permettent d’évaluer l’état du patient avant tout traitement, de suivre l’efficacité et les effets secondaires des traitements (chirurgicaux, médicaux ou par radiothérapie) et de poser des diagnostics en Hémato-oncologie
Ils sont réalisés sur des équipements modernes, régulièrement actualisés, qui participent à l’optimisation de l’organisation du parcours du patient ;
Ils permettent le suivi de l’efficacité des nouveaux traitements médicaux (immunothérapie, thérapies ciblées) :
En collaborant avec l’Unité de Génétique Tumorale pour le traitement pré-analytique des biopsies liquides permettant l’analyse de l’ADN tumoral circulant
En développant des examens permettant d’évaluer ces thérapies, particulièrement dans la prise en charge multidisciplinaire des cancers du sein, des cancers hématologiques et de la thyroïde.

Les biologistes de l’Unité ont développé une expertise en Hémato-oncologie, en consolidant le secteur spécialisé de Cytométrie Flux et les thématiques de recherche dans ce domaine, notamment sur la Leucémie Lymphoïde Chronique, et en participant activement à des groupes de travail régionaux et nationaux.

Le laboratoire participe également au développement et à la valorisation des collections biologiques au sein du Centre de Ressources Biologiques pour les projets de recherche clinique ou thérapeutique, ainsi qu’à l’optimisation de la filière pré-analytique pour la certification de l’Unité de Recherche Clinique selon la norme ISO-9001

Enfin, de nouvelles thématiques autour de la cytométrie (analyse des sous-populations lymphocytaires, tris cellulaires pour analyses génétiques, recherche de cellules tumorales circulantes) sont développées en collaboration avec les équipes cliniques et d’imagerie interventionnelle.

L’équipe

Dr Françoise DURRIEU (responsable d’unité), Dr Julie BLANCHI

Manuel de prélèvement : cliquez ici
Spécifications d’examens biomédicaux : BIOL-DCO-0019

Unité d'Oncogénétique - Laboratoire de génétique moléculaire

L’Unité d’Oncogénétique où sont réalisées les consultations de patients et de leurs familles chez lesquels on suspecte la présence d’une anomalie génétique prédisposant à la survenue de cancers et où sont recherchées, dans l’ADN des globules blancs du sang, les mutations de gènes de prédisposition à la survenue de cancers. Les praticiens de cette unité ont une expertise reconnue dans la génétique de prédisposition des cancers du sein, gynécologique et digestive.

L’équipe

Responsable d’unité : Dr Michel LONGY
Cliniciens : Dr Michel LONGY, Dr Emmanuelle BAROUK, Dr Virginie BUBIEN, Dr Claire SENECHAL DAVIN
Pharmacien : Pr Nicolas SEVENET (Responsable du laboratoire de Génétique Moléculaire)
Ingénieurs biologistes : Françoise BONNET-DORION, Mme Natalie JONES
Conseillère en Génétique : Mme Eglantine JOLLY
Bio-informaticien : Jennifer CHIRON

> En savoir plus sur le laboratoire de génétique moléculaire

> En savoir plus sur l’unité d’oncogénétique

Unité de Pathologie Moléculaire

Le diagnostic et le pronostic d’une lésion cancéreuse reposent sur des critères cliniques et anatomopathologiques. Au sein du Département de Biopathologie, l’Unité de Pathologie Moléculaire dispose de technologies de screening moléculaire, permettant l’identification d’altérations moléculaires spécifiques ou caractéristiques du diagnostic, de signature pronostique ou l’identification de cibles thérapeutiques permettant d’orienter les choix thérapeutiques, en particulier vers les thérapies ciblées.

L’équipe

Dr Houda BEN REJEB , Dr Benjamin BONHOMME, Dr Sabrina CROCE, Dr Emmanuel KHALIFA, Dr Gaëtan MACGROGAN, Dr Isabelle SOUBEYRAN (responsable d’unité).

Ingénieurs: Mme Isabelle HOSTEIN, Mme Claire LARMONIER

Bioinformaticienne : Mme Jennifer CHIRON

Pour en savoir plus sur les activités diagnostiques

L’unité de pathologie moléculaire participe aussi aux activités de Recherche Clinique, notamment en réalisant des screening moléculaires dans le cadre d’essais thérapeutiques.

Pour en savoir plus sur les activités de recherche

Pour nous envoyer un prélèvement en vue d’un examen de Pathologie Moléculaire :

Manuel prélèvement : ACP-DCO-0007

Autres documents :

Catalogue des analyses de Pathologie moléculaire : PAM-DCO-0002
Fiche de prescription de la PGMC : PAM-DEXT-0103
Fiche de prescription BRCA Ovaire : PAM-DEXT-0104
Fiche de prescription ADN circulant : PAM-DEXT-0105
Fiche de prescription Cancer sein : PAM-DEXT-0116
Modalités de transport des échantillons vers l’unité de Pathologie Moléculaire : PAM-FICO-0001
Critères d’acceptation des prélèvements dans l’unité de Pathologie Moléculaire : PAM-FITC-0050

Consulter la liste RIHN en vigueur : en cliquant ici.

Centre de Ressources biologiques

Le Centre de Ressources Biologiques où sont stockés des fragments de tumeurs et les cellules sanguines des patients en vue de leur analyse par biologie moléculaire à visée sanitaire ou dans le cadre de protocoles de recherche fondamentale ou clinique.

L’équipe

Mme Sylvie HUET (responsable d’unité)

En savoir plus sur le Centre de Ressources Biologiques